SARS-CoV-2 stebėsena Lietuvoje
SARS-CoV-2 virusas buvo pirmą kartą pastebėtas 2019 metų pabaigoje Kinijoje ir po kelių mėnesių pasiekė Lietuvą. Atsakant į viruso plitimą šalyje, buvo paskelbtas pirmasis karantinas ir vėliau – ekstremali padėtis. 2020 m. rudenį Lietuvoje pradėta oportunistinė stebėsena, bendradarbiaujant su universitetais ir privačiomis įstaigomis, renkant ir tiriant mėginius. Nuo 2021 m. kovo pradėta reprezentatyvi stebėsena, kurios metu mėginiai buvo renkami iš įvairių Lietuvos regionų. Nuo 2022 m. lapkričio mėginių ėmimas buvo sutelktas į atrinktus pirminės sveikatos priežiūros centrus. Vėliau, 2024 m. spalio, atslūgus SARS-CoV-2 pandemijai, stebėsena buvo išplėsta įtraukiant ir kitų viršutinių kvėpavimo takų virusų, tokių kaip gripas ir RSV, tyrimus. Nors sekoskaita šiems virusams bus pradėta ateityje, gripo tipavimas jau vykdomas.
Patvirtinti SARS-CoV-2 atvejai
Patvirtintų SARS-CoV-2 atvejų skaičius nuolat kito priklausomai nuo infekcijos bangų. NVSPL rinkti mėginiai buvo tiriami antigeno mėginius renkančiose instucijose. Susumuoti antigeno testų rezultatai pateikti paveikslėlyje 1.
Pav. 1. Stebėsenos mėginių susumuoti antigeno testų rezultatai.
Taip pat visiems mėginiams buvo atliekami ir PGR testai, kurių rezultatai yra pateikti paveikslėlyje 2.
Pav. 2. Stebėsenos mėginių susumuoti PGR testų rezultatai.
Nuo 2024 m. spalio PCR testavimas apėmė ir ŪVKTI mėginius, leidžianti stebėti tendencijas gripui, SARS-CoV-2 ir RSV. Tipavimo duomenys pateikti paveikslėlyje 3, kuriame yra sutipuoti ir gripo variantai pagal HA ir HE segmentus (Gripas A: H1pdm, H3 ir Gripas B: VIC).
Pav 3. Stebėsenos mėginių tipavimo rezultatai.
SARS-CoV-2 koncentracija nuotekose
Nuotekų mėginių analizė leidžia stebėti SARS-CoV-2 plitimą visuomenėje. Vidutinis viruso RNR kiekis nuotekų mėginiuose, normalizuotas pagal aptarnaujamų žmonių kiekį, parodytas paveikslėlyje 4.
Pav 4. Vilniaus, Kauno ir Klaipėdos nuotekos nustatytas SARS-CoV-2 RNR kiekis, normalizuotas pagal aptarnaujamų žmonių kiekį.
Genominė stebėsena leidžia sekti dominuojančias SARS-CoV-2 linijas Lietuvoje. Sekvenuotų mėginių pasiskirstymas pagal ECDC standartus pateiktas paveiklėlyje 5.
Pav. 5. SARS-CoV-2 linijos nustatytos stebėsenos mėginiuose, sugrupuotos pagal ECDC rekomendacijas.
Nuo pradinio Wuhan (B) varianto iki Alpha, Delta, Omicron ir jų sublinijų, įvairios linijos buvo nustatytos ir Lietuvoje. Šios linijos atspindi virusų linijų kaitą ir prisitaikymo tendencijas.
Sekvenavimo duomenys yra dalijami su GISAID, ECDC, SAM ir NVSC, prisidedant prie regioninės ir pasaulinės SARS-CoV-2 stebėsenos.
Atnaujinimo data: 2026-07-07