Gripas

2024 m. ataskaita dėl šalyje cirkuliuojančių gripo virusų atitikimo gripo vakcinai

2023-2024 m. gripo sezono metu vyravo A/H1N1 gripo virusai. A/H3N2 ir B gripo virusai šalyje taip pat buvo nustatomi.

Tyrimai atlikti Nacionalinėje visuomenės sveikatos priežiūros laboratorijoje ir regioninėje referentinėje gripo laboratorijoje Francis Crick Institute, Jungtinėje Karalystėje.

A/H1N1 gripo virusų analizė

Genų sekoskaita parodė, kad visi Lietuvoje išskirti A/H1N1 virusai priklauso 5a.2a genetinei grupei, iš kurių 5 susitelkę 5a.2a pogrupyje C.1.9. Pasaulyje vyrauja 5a.2a genetinė grupė, išskyrus Ameriką, kur vyrauja 5a.2a.1 grupė. Europoje 5a.2a grupei priklausantys gripo virusai buvo aptikti daug dažniau nei 5a.2a.1 grupei priklausantys virusai.

5a.2a virusuose, kuriems būdingi šie aminorūgščių pakeitimai: K54Q, A186T, E224A, R259K ir K308R, buvo pastebėti ir keli pogrupiai: pogrupis C.1, apibrėžtas aminorūgščių pakeitimu I418V, kuris suskilo į du papildomus subpogrupius: C.1.8, kuriam būdingas V47I su I96,T pakeitimas ir C.1.9, kuriam būdingas K169Q pakeitimas. Daugiau kaip 80 % H1pdm virusų, sekvenuotų visame pasaulyje, priklauso C.1.9 subpogrupiui. Lietuvoje taip pat vyrauja C.1.9 subpogrupiui priskiriami gripo virusai.

A/H3N2 gripo virusų analizė

Per šį ataskaitinį laikotarpį didžioji dauguma Europoje aptiktų A/H3 virusų priklauso 2a.3a.1 grupei, kuriai būdingas aminorūgščių E50K pakeitimas būdingas ir 2a.3a grupei. Visi tirti Lietuvos A/H3N2 virusai taip pat priklauso 2a.3a.1 grupei.

B/Victoria gripo virusų analizė

Visi tirti Lietuvos B/Victoria virusai priklauso V1A.3a.2 grupei, iš kurių 3 susitelkę V1A.3a.2 (C.5.6) ir 1 pogrupyje V1A.3a.2 (C.5.1).

V1A.3a.2 grupės virusai, kuriems būdingi A127T, P144L, N150K, G184E, N197D (-CHO), K203R ir R279K aminorūgščių pakeitimai vyravo nuo 2022 m. vasario mėn. visose šalyse, kuriose buvo nustatyti B/Victoria gripo virusai.

Per šį ataskaitinį laikotarpį Europoje buvo aptikta ir apibūdinta tik nedidelė B/Viktorijos virusų dalis. V1A.3a.2 pogrupiui C.5 (būdingas D197E aminorūgščių pakeitimas) priskiriami dauguma B tipo gripo virusų, būdingų dabartiniam gripo sezonui. Vyraujantis C.5 subpogrupis C.5.1 su E183K aminorūgščių pakeitimu.

B/Yamagata gripo virusų analizė

B/Yamagata gripo virusai neaptikti nuo 2020 m. kovo mėn.

Apibendrinimas

Visi Lietuvoje tirti H1N1, A/H3N2 ir B/Victoria gripo virusai yra labai panašūs į gripo vakcinos sudėtyje esančius virusus ir yra gerai atpažįstami antikūnų, susidarančių prieš vakcininius virusus.

Visi tirti gripo virusai jautrūs antivirusiniams vaistams – neuraminidazės inhibitoriams.

Pav.: A H1 (HA geno) filogenetinis medis

Pav.: A H3 (HA geno) filogenetinis medis

Pav.: B Victoria (HA geno) filogenetinis medis

2025 m. ataskaita dėl šalyje cirkuliuojančių gripo virusų atitikimo gripo vakcinai

2024-2025 m. gripo sezono metu vyravo A gripo virusai. B gripo virusai šalyje taip pat buvo nustatomi.

Tyrimai atlikti Nacionalinėje visuomenės sveikatos priežiūros laboratorijoje ir regioninėje referentinėje gripo laboratorijoje Francis Crick Institute, Jungtinėje Karalystėje.

A/H1N1 gripo virusų analizė

Genų sekoskaita parodė, kad dauguma Lietuvoje išskirtų A/H1N1 virusų priklauso 5a.2a genetinei grupei, kurie susitelkę pogrupyje C.1.9.3 ir C.1.9 Kita dalis virusų priklauso 5a.2a.1 genetinei grupei D.3 pogrupiui.

Pasaulyje vyravo 5a.2a genetinė grupė ir C.1.9.3 pogrupis bei mažesne dalimi 5a.2a.1 grupei priklausantys virusai. Dauguma pasaulyje sekvenuotų A/H1N1 virusų priklauso D.3.1 pogrupiui, kuriam būdingi T120A, I372V, I460T ir V520A aminorūgščių pakeitimai, o dalis šių virusų taip pat turi R113K. D.3.1 pogrupio virusai vyrauja Amerikoje, Australijoje ir Pietų Azijoje, Šiaurės Europoje, JK ir Airijoje. Pietų Amerikoje D.5 pogrupio ir bazinio D pogrupio virusų aptikta nedidelė dalis. 5a.2a virusų atveju pogrupis C.1.9.3 su aminorūgščių pakeitimais S83P ir I510T vyrauja Vakarų Afrikoje ir Pietų Afrikoje, Artimuosiuose Rytuose, Pietų ir Rytų Europoje, Šiaurės Azijoje ir kai kuriose Okeanijos šalyse. Pogrupis C.1.9.1 su aminorūgščių pakeitimais P137S vyrauja Zambijoje ir kartu cirkuliuoja kai kuriose Europos šalyse, Rusijos Federacijoje ir Omane, o bazinis pogrupis C.1.9 vyrauja Kinijoje, Madagaskare ir Kenijoje ir kartu cirkuliuoja Europoje, Šiaurės ir Rytų Azijoje.

A/H3N2 gripo virusų analizė

2025 m. didžioji dauguma pasaulyje aptiktų A/H3 virusų priklauso 2a.3a.1 (J.2) grupei, kuriai būdingi aminorūgščių N122D (‑CHO) ir K276E pakeitimai. Visi tirti Lietuvos A/H3N2 virusai taip pat priklauso 2a.3a.1 (J.2) grupei.

Šiuo laikotarpiu labai mažomis proporcijomis buvo aptikti ir kiti ne J.2 pogrupiai, pavyzdžiui, J.1.1 (su aminorūgščių pakeitimu S145N), vyraujantis tik Madagaskare ir aptiktas Graikijoje bei Italijoje.

B/Victoria gripo virusų analizė

Nuo 2025 m. vasario mėn. šiaurės pusrutulyje vyrauja B/Victoria gripo virusų pogrupis C.5.1 ir C.5.7.

Visi tirti Lietuvos B/Victoria virusai priklauso V1A.3a.2 grupei, iš kurių dalis susitelkę V1A.3a.2 (C.5.1), kita dalis pogrupyje V1A.3a.2 (C.5.6).

V1A.3a.2 (C.5) (būdingas D197E aminorūgščių pakeitimu) C.5.6 pogrupis su D129N aminorūgščių pakeitimu vyrauja Čilėje, Kanadoje, Australijoje, Naujojoje Zelandijoje, Rusijos Federacijoje, Indijoje, Bangladeše ir kai kuriose Europos šalyse, o naujas pogrupis C.5.6.1, kuriam būdingi papildomi pakeitimai T37I, E128D ir T199A, vyrauja Honkonge, Saudo Arabijoje, JAE, Maldyvuose ir aptinkamas Europoje, Pietų Azijoje, Rusijos Federacijoje, Peru ir Urugvajuje. Pogrupis C.5.1 su E183K vyrauja kai kuriose Centrinės Amerikos ir Europos šalyse; C.5.7 su E183K ir E128G vyrauja Vakarų Ramiojo vandenyno regione, kai kuriose Afrikos šalyse, Mongolijoje ir Brazilijoje.

Be C.5 virusų retais dažniais buvo aptikti ir kiti pogrupiai, pavyzdžiui, nauji iš C.3 kilę pogrupiai (E128K, A154E, S208P): JAV aptiktas C.3.1 su papildomu D197N, o JAV aptiktas labai mažu santykiu ir C.3.2 su papildomais Y179H, D197N ir S208P. C.2 pogrupis su T182A, D197E, T221A buvo aptiktas tik Ganoje.